　上寺山余慶寺は孝謙天皇の時代が始まる天平勝宝元年（749）、報恩大師により開山された天台宗の古刹で、開山以来千二百五十年の歴史を重ねております。

寛文六年（1685）の古文書には「頂坊本乗院、寺中　定光院、吉祥院、他末寺を含め十一坊」の名が記されていますが、現在は、餘慶寺一山は恵亮院、本乗院、吉祥院、定光院、明王院、圓乗院の六院（天台宗寺籍簿順）となっており、一山一寺多院制という形を今に残す貴重なお寺です。

餘慶寺本堂でお勤めをする僧侶の住居を支院(シイン）とか塔頭（タッチュウ）と呼びます。

古い呼び方で「頂坊（ちょうぼう）」というのがありますが、これは山内を統括し寺務や財産の管理を行ない、本山や寺社奉行との交渉の役割を担う住職のことで、「頂坊」を「本坊」とも言います。各院の代表住職を塔頭（たっちゅう）と言います。

　大正のはじめまで上寺山餘慶寺の「頂坊」は本乗院でしたが、現在は各六院の「塔頭」が交代で餘慶寺の寺務を担当し、「頂坊」を勤めています。